Будучи ещё ребёнком, Сиро Эмия теряет обоих родителей во время загадочного, буквально пламя охватившего пожара, который трудно объяснить. Ему удаётся выжить благодаря помощи незнакомца по имени Киритсугу Эмия, который утверждает, что он маг и становится его отцом-приёмным. В семейных разговорах Сиро узнаёт, что его отец мечтал стать «Героем справедливости» — защитником людей и хранителем слабых. Под влиянием идей Киритсугу Сиро загорается желанием целиком посвятить себя помощи другим и просит усыновителя научить его магическому искусству, но оказывается, что он почти неспособен овладеть большинством базовых магических дисциплин. В один день он становится свидетелем дуэли между двумя чрезвычайно могущественными магами и нечаянно втягивает в битву девушку в сверкающих доспехах ради её защиты. Позже он узнаёт, что это противостояние — «Война за Святой Грааль» — серия схваток между семью могущественными магами. Маги призывают «Слуг» — героических духов древних эпох — чтобы они сражались за них за обладание артефактом, исполняющим желания, Святым Граалем. История сосредоточена на Сиро, его непростой позиции в войне и личной борьбе за сохранение своих идеалов перед лицом конфликта.
