В далёком будущем человечество истощило ресурсы Земли и устремилось к звёздам в попытке найти спасение в космосе. Но по непонятной причине планы рушатся: спустя время люди вынуждены возвращаться на планету и обнаруживают, что большая часть её непригодна для жизни, за исключением обширной зоны вокруг Японии. Чтобы разместить всё население, вокруг этой территории образовали новые зоны обитания. В поиске пути к возвращению в космос начинается переосмысление истории человечества согласно священной книге Завета. Однако в 1431 году эпоха реконструкции переживает кризис: жители зон, расположенных вокруг Японии, восстают, захватывают Японию и делят её на феодальные владения, заставляя уйти коренной народ. Теперь, в 1648 году э.р., беженцы живут в городе-корабле, который бесконечно движется над континентом забытой родины и контролируется Союзом реконструкции. В воздухе витает слух о грядущем апокалипсисе и вооружённой конфронтации, поэтому реконструкция ставится на паузу, чтобы выяснить, что произойдёт после 1648 года. В такую ситуацию Тори Аой, руководитель Академии Высшей Федерации и президент студенческого совета, собирает однокурсников и ведёт их в поход за возвращением утраченной родины.
