В этом вымышленном мире живут алхимики — люди, умеющие управлять материей и превращать предметы по собственной воле. Их силы строго регулируются основным Законом алхимии: чтобы получить что‑то, необходимо заплатить за это равной ценой. Единственный путь к обходу этого правила лежит через легендарный философский камень, чье существование окутано тайной и легендами. Главные герои — братья Элрики, Эдвард и Альфонс, чьи детские годы оказались омрачены попыткой вернуть к жизни их матери. Но эта попытка оборачивается трагедией: Альфонс лишается всего своего тела, Эдвард теряет руку и ногу. Душу Альфонса Эдвард удаётся сохранить, запечатав её в древнем доспехе. Спустя годы Эдвард успешно сдает государственный экзамен на звание алхимика и получает прозвище «Стальной алхимик». Так начинается их долгий и рискованный путь — поиск философского камня ради возвращения утраченного и исправления прошлых ошибок.
