Анна Сасаки — замкнутая школьница, которую мучает астма и которая почти не находит себе друзей, предпочитая карандаши и рисунки живому общению. Ей предстоит пожить у дальних родственников Ёрико — приемной матери, в небольшом провинциальном городке. Но городок оказывается не таким простым и скучным: здесь есть таинственный особняк на краю причала, дом на отмели, который постоянно привлекает её воображение. Именно там Анна встречает Марни, девушку, которая живет в этом доме, и между ними завязывается крепкая дружба. Однако однажды Марни исчезает без следа, а в поместье въезжают новые владельцы — семья Сааки. С этого момента Анна начинает узнавать о своей подруге вещи совершенно иного, странного характера — тайны, которые переворачивают её мир и отношение к дому, в котором она когда-то нашла дружбу.
