Юный детектив Хадзимэ Киндайти, его подруга Миюки и инспектор Кэммоти прибывают на торжественную церемонию открытия Дома Оперы. На афише объявлена новая постановка «Призрак Оперы», которую рекламируют как событие сезона. Но уже в первые минуты спектакля начинается череда смертей — таинственный Призрак расправляется над участниками труппы, один за другим. Хадзимэ вынужден снова взять расследование в свои руки: он опрашивает актёров, ищет скрытые мотивы и распутывает хитросплетения лжи, чтобы понять, кто стоит за убийствами. В зале с каждым шагом крепнет напряжение: кажется, что каждый человек может оказаться убийцей, а каждый шепот за кулисами скрывает новый след. В итоге юному детективу приходится раскрывать запутанное преступление, возвращая мир театру и выявляя мотивы преступника, проникшего в сердце оперы.
