На юге Японии раскинулся остров Южный Крестот, поросший пышной зеленью. Однажды ночью берег неожиданно принимает юношу по имени Такуто Цунаси, прибывшего из Японии без багажа и вещей. Он поступает в Старшую школу Южного Креста, и своим ярким, жизнерадостным характером быстро становится ближе к одноклассникам, включая Вако Агэмаки и Сугату Синдо. Но за обычной школьной сущностью скрывается древняя тайна: в подвальных коридорах спрятаны десятки спящих гигантов — загадочных меха‑устройств, известных как «Кибоди». Обычные люди могут ими руководить, но только в параллельной вселенной под названием Нулевое Время. Вскоре Такуто оказывается втянутым в противостояние с таинственной группировкой «Мерцающий Звёздный Крест», которая стремится захватить Кибоди и разрушить печати четырёх святых девушек, мешающие использованию Кибоди за пределами Нулевого Времени.
