Обычный старшеклассник Аруто Кирихара увлечён историями об Алисе, написанными таинственным отшельником Алтернайтом Л. Тахионом, происходящими в этом альтернативном мире. Однажды ночью, когда он пишет свою версию потенциальной «третьей книги», он замечает девушку, летящую на фоне полной Луны—и она кажется точной копией той Алисы, которую он придумал в воображении. Выбежав из дома и догнав летающую фигуру, Аруто оказывается в библиотеке, где становится свидетелем её схватки с другой девушкой в костюме. Так начинается его внезапное знакомство с миром Алисы — элитного круга дерзких подростков, которые в Стране Чудес сражаются за пределами обычного пространства, чтобы украсть «скрытые истории» друг у друга. Когда все истории будут собраны, они образуют легендарный третий том «Вечной Алисы», и держатель тома получит одно желание. Скорее всего, это не Аруто, неспособный превратиться в волшебную девушку. Но возможно, именно его любящая младшая сестра Кириха Кирихара или та девушка его мечты, Арису Арисугава, окажутся тем человеком.
