События разворачиваются в 2185 году вокруг лейтенанта Джеймса Веги после разрушения первой Нормандии и исчезновения капитана Шепарда. В пограничных системах Терминуса люди наблюдают таинственное исчезновение колоний, будто их не существовало вовсе. После поражения загадочного противника, прозванного «Владыкой», на сцену выходят новые силы и угрозы. Когда угрозы приближаются к поселению, которое охраняет Вега, он оказывается на грани спасения дома с минимальными шансами на помощь свыше — ему доверено держать оборону в одиночку, опираясь лишь на своих людей. Его команда становится оплотом надежды, а память о Шепарде напоминает о том, каким должен быть лидер. Джеймс начинает осознавать цену каждого выбора: порой отсутствует безошибочный вариант, остаются только последствия, с которыми придётся жить. История исследует тему ответственности, самопожертвования и цены, которую приходится заплатить ради защиты близких и дома.
